El GOI forma parte de CLIPSAS, para conseguir ingresar ha sido necesaria una investigación por parte del Grande Oriente Lusitano, Gran Orient de Catalunya y la Gran Logia Simbólica de España. Tras el acuerdo favorable por parte de los tres Orientes se procede a ingresar en la famosa organización masónica. 

La admisión se realizó en la 51ª Asamblea en Casablanca el 19/05/2012. En ella el GOI ha sido representada por el Gran Maestre Manuel Rajo López y el Gran Inspector Álvaro Marcos Garzón. 

El 14 de Mayo de 2021 Manuel Rajo ha sido elegido vicepresidente de esta misma asociación, como bien indica el Gran Maestro del Grande Oriente Ibérico: 

“Es un momento muy especial el que vive nuestra Obediencia. El pasado 14 de mayo fue un día muy afortunado para el G:.O:.I:., ya que un nuestro Querido Hermano Manuel Rajo fue elegido vicepresidente del Bureau de CLIPSAS (Centro de Enlace y de Información de las Potencias Masónicas Firmantes del Llamamiento de Estrasburgo), en su 60ª Asamblea General, que tuvo lugar del 12 al 15 de Mayo, en Lisboa. Nuestra Obediencia es miembro desde 2012 de CLIPSAS, que es la mayor Organización Mundial de Masonería, hoy con 108 Obediencias de los 4 continentes del mundo.”  Enlace del artículo.